Svetelné a elektrónové mikroskopy sa navzájom líšia. Porovnajte variácie podobných výrazov.
Optický mikroskop môže vidieť iba špecifické bunkové štruktúry, ako sú bunkové steny, chloroplasty, označené chromozómy, mitochondrie, jadrá atď., Zatiaľ čo elektrónový mikroskop dokáže pozorovať všetky bunkové štruktúry. Zjednodušene povedané, svetelný mikroskop dokáže odhaliť mikroskopickú štruktúru bunky, zatiaľ čo elektrónový mikroskop môže odhaliť jej submikroskopické zloženie.
Primárnym rozdielom je zväčšenie. Bez ohľadu na to, aký veľký zoom sa používa, optické mikroskopy majú maximálne zväčšenie, ktoré ľudské oko nedokáže rozlíšiť. y(min)=0.61*vlnová dĺžka / (n*sinu) Maximum je približne 1,5, aj keď je n*sinu ponorené v oleji, a zvyšné množstvá závisia od veľkosti vlnovej dĺžky. Preto je približovanie zbytočné, pretože maximálne zväčšenie optického mikroskopu je približne 1000-krát. Keďže vlnová dĺžka elektrónových lúčov používaných pri zobrazovaní elektrónovým mikroskopom je výrazne kratšia ako vlnová dĺžka viditeľného svetla, dokážu rozlíšiť drobné detaily, čo umožňuje zväčšenie až o niekoľko miliónov.
