V roku 846 otvoril Carl Zeiss malú dielňu na výrobu presných optických prístrojov na ulici Neugasse 7 v Jene.
V roku 1866 bol predaný 1000. mikroskop. Pán ErnstAbbe sa pripája k spoločnosti pána Zeissa a založil mikroskopickú technológiu Zeiss na vedeckom základe.
1884-1891: Založenie „Sklárne Schott & Gemossen“ v Jene, Carl Zeiss zomrel v roku 1888, bola založená Nadácia Carl Zeiss.
V roku 1900 sa s pomocou pána Augusta Köhlera začala malá dielňa pána Zeissa celosvetovo rozširovať a rovnako tak položila pevný základ pre fluorescenčnú mikroskopiu.
V roku 1936 bol v spolupráci s pánom Fritsom Zernike predstavený prvý mikroskop s fázovým kontrastom na analýzu živých buniek. Pán Frits Zernike získal v roku 1953 Nobelovu cenu za fyziku.
1949, Ekonomický zázrak a elektronický vek: Komercializácia transmisnej elektrónovej mikroskopie v spolupráci s AEG Corporation.
V roku 1989 bol stupeň digitalizácie čoraz vyšší a mikroskop sa stal pracoviskom na spracovanie obrazu. Rýchlo vyvinutá softvérová technológia a digitálny fotoaparát rozšírili oblasť použitia mikroskopu.
V roku 2000 technológia riadenia prevádzky pomohla zobrazovacej technológii a mikroskop sa stal automatizovaným systémom zobrazovania obrazu.
