Pri výbere, ktorý systém použiť alebo kúpiť, je prvým zvážením, ktoré parametre sú pre experiment najdôležitejšie: rýchlosť, citlivosť, rozlíšenie, diskriminácia na viacerých vlnových dĺžkach alebo životaschopnosť buniek, z ktorých mnohé sú v konflikte a potrebujú byť kompromitovaný. Druhou úvahou je, či je účel použitia tohto systému na nejakú špecifickú detekciu, alebo na všeobecnú detekciu. Všeobecne povedané, systémy s väčšou flexibilitou pri výbere hardvéru sú vhodnejšie na špecifické kontroly, ale majú vyššie technické požiadavky na montáž a použitie. Výber systému s vyspelým softvérom šetrí čas. Bez ohľadu na typ systému, ktorý si vyberiete, najskôr ho otestujte s vlastnými experimentálnymi materiálmi. Obchodný zástupca firmy musí pri predvádzaní zariadenia vybrať vhodný filter, budiaci zdroj svetla a šošovku objektívu podľa použitého fluorescenčného farbiva v experimente a požadovaného zväčšenia. Okrem biologického materiálu, ktorý je predmetom záujmu, by sa na porovnanie rôznych systémov na základe získaných kvantitatívnych údajov mala použiť séria sklíčok obsahujúcich rôzne farbivá.
mikroskop
Prvá vec, ktorú musíte urobiť, je vybrať si medzi vzpriameným (pri pohľade zhora) alebo inverzným (pri pohľade zdola) mikroskopom. Vo všeobecnosti sú inverzné mikroskopy výhodné pri pozorovaní živých buniek a získavaní 3D obrazov s vysokým rozlíšením. Stupeň inverzného mikroskopu uľahčuje experimentátorom manipuláciu so vzorkami, uľahčuje mikroinjekciu a uľahčuje používanie inkubátorov riadených prostredím. Inverzný mikroskop zároveň poskytuje lepšiu mechanickú stabilitu pre inštaláciu CCD kamery.
Výber objektívu
Výber objektívu a režim jeho použitia je dôležitým parametrom, ktorý ovplyvňuje kvalitu obrazu. Výber správneho mikroskopického objektívu pre montážne médium je rozhodujúci pre zobrazovanie. Objektívy mikroskopu môžu fungovať vo vzduchu (zvyčajne nízke zväčšenie), ponorením do vody (WI) alebo glycerolovým roztokom (80 percent), silikónovým olejom alebo olejom pre bežné objektívy (RI 1,50 až 1,534). Šošovka objektívu je najdôležitejšou súčasťou mikroskopu a musí sa pravidelne kontrolovať a čistiť.
